במסגרת היחידה מתקיימות שלוש מרפאות, מרפאת סוכרת ילדים, מרפאת אוסטאופורוזיס בילדים, ומרפאה לאנדוקרינולוגיית ילדים, המטפלת בילדים עם בעיות הורמונליות מגוונות, ביניהן קומה נמוכה, הפרעות בהתבגרות המינית, בעיות בבלוטות התריס, יותרת המוח ויותרת הכליה, בעיות ייחודיות בבנות מתבגרות והשמנה.