ביופסיה של גושים ברקמות הרכות היא פרוצדורה מאוד בטוחה. לפני הפרוצדורה המטופל עושה בדיקות דם. לא דרוש שום הכנה נוספת מהמטופל, ולא צריך לצום לפני הפרוצדורה.
במהלך הפרוצדורה, המטופל שוכב על מיטה במכון האולטרסאונד, ובפרוצדורה סטרילית ולאחר אלחוש של האזור, מכניסים מחט קטן לגוש ומוציאים דגמים מאוד קטנים שנשלחים לבדיקה פתולוגית. המטופל משוחרר לאחר הפרוצדורה.