המעבדה לאפיון תאים מבצעת אבחנה של ממאירויות המטולוגיות שונות, אנמיה, חסר אימוני באמצעות זיהוי חלבונים ייחודיים על פני סוגי תאי הדם השונים וסטטוס הממאירות שלהם. הבדיקות מבוצעות על דם פריפרי, מח עצם, בלוטות לימפה, ביופסיות ונוזלי גוף שונים. האפיון מבוצע ע"י מכשיר ה-FACS (Flow Cytometer) המזהה צביעה פלואורוסנטית של חלבונים אלו. במעבדה קיימים שני מכשירי FACS, בחדיש מבניהם יש 3 לייזרים המאפשרים זיהוי בו זמני של 12 חלבונים שונים. מכשיר זה רגיש מאוד ובעל יכולת לזהות כמויות תאים קטנות מאוד.