לאור זאת הביטוי הקליני של ASD מגוון ביותר וכמובן גם הגורמים להפרעה שונים ומגוונים. יש אמרה ידועה בתחום האוטיזם: "אם הכרת ילד אחד עם אוטיזם – הכרת ילד אחד עם אוטיזם". כיוון שכל ילד מתנהג אחרת ומגיב אחרת לטיפול – קשה מאוד ללמוד מילד אחד על חברו.
למרות שנים רבות של מחקר רפואי שהושקעו בו מאמצים גדולים בכל רחבי העולם, לא קיים עדיין טיפול תרופתי שהוכח כמסייע בתסמיני הליבה של ההפרעה. אחת הסיבות העיקריות לכך היא השונות הרבה בין המטופלים.
ישנם טיפולים רבים שכנראה עוזרים משמעותית ב ASD אך כל אחד מהם עוזר רק לחלק קטן מהסובלים מההפרעה. הדרך היחידה לטיפול מוצלח ב ASD היא לאפיין מראש את אותה הקבוצה שאצלה הטיפול עוזר. למשל: מי שיש לו פגם בגן מסוים, בעברו פגות והוא מציג קושי התנהגותי ספציפי