קולונוסקופיה וירטואלית הקרויה גם CT Colonography היא בדיקת CT. הבדיקה מתבצעת בטכניקה, המאפשרת הערכה של חלל המעי הגס ויכולה לאבחן פוליפים או גידולים בדופן המעי. הבדיקה דומה לקולונוסקופיה אנדוסקופית ומאפשרת איתור של פוליפים בקוטר העולה על 5 מילימטרים וכן גידולים במעי הגס.
הבדיקה מאפשרת הדמיה של כל אברי הבטן. למעשה, מדובר בבדיקת חוקן המתבצעת תחת CT, כאשר באמצעות עיבודי מחשב לאחר הבדיקה ניתן להדגים את דופנות המעי הגס לכל אורכן כמו בקולונוסקופיה אנדוסקופית. לאור העובדה שמבוצעות שתי סריקות CT, רמת הקרינה של הקולונוסקופיה הווירטואלית מעט גבוהה יותר מבדיקת CT בטן רגילה. הבדיקה מבוצעת בדרך כלל ללא הזרקת חומר ניגוד.
לאחר הכנת המעי ע"י חומרים משלשלים (ההכנה זהה לזו של קולונוסקופיה רגילה) נקלט הנבדק ביחידת ה- CT. הנחיות מפורטות לגבי ההכנה ניתנות בעת זימון התור. 
מהלך הבדיקה:
בתחילת הבדיקה נעשה ניפוח של המעי עם אוויר. לאחר מכן נעשית סריקה של הבטן על ידי מכשיר ה-CT. הנבדק יקבל הנחיות על דרך השכיבה במהלך הבדיקה.