מעבדת המחקר של המכון לנפרולוגיה של הילד עוסקת בזיהוי הבסיס התורשתי למחלות כליה בילדים בכוונה לשפר את ההבנה של הפיזיולוגיה הכלייתית ולשפר את תכניות הטיפול. 
במכון מתבצעות מספר עבודות קליניות הבודקות היבטים ייחודיים של ילדים הסובלים ממחלות כליה כרוניות וילדים מושתלי כליה, בכללם:

•    גורמי סיכון לתחלואה לבבית בילדים הסובלים ממחלת כליה כרונית וילדים מושתלי כליה.
•    תפקוד לבבי ותמונת מצב של כלי הדם בילדים ובמבוגרים צעירים הסובלים ממחלת כליה כרונית.
•    הפרעות במאזן הסידן-זרחן וויטמין D בילדים עם מחלת כליה כרונית.